Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms