Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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Hddc2Q3SXD3 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hddc2Q3SXD3 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms