Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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