Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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