Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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