Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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