Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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H2-M1F7CXU4 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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