Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms