Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Grik3B1AS29 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms