Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cldn8Q9Z260 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn8Q9Z260 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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