Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms