Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rabgef1Q9JM13 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rabgef1Q9JM13 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rabgef1Q9JM13 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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