Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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