Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc47Q9D024 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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