Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms