Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprtQ99M80 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PtprtQ99M80 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms