Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Apobec3Q99J72 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Apobec3Q99J72 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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