Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms