Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NipblQ6KCD5 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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