Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Shank3Q4ACU6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms