Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Rnf40Q3U319 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Rnf40Q3U319 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Rnf40Q3U319 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rnf40Q3U319 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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