Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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