Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Sh3bp2Q06649 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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