Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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