Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms