Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms