Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Gm2056J3QQ02 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms