Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apba1B2RUJ5 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apba1B2RUJ5 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms