Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Spocd1B1ASB6 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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