Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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