Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CtcflA2APF3 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms