Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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