Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rdh11Q9QYF1 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rdh11Q9QYF1 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms