Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Uchl3Q9JKB1 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Uchl3Q9JKB1 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms