Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn16Q925N4 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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