Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ssh3Q8K330 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ssh3Q8K330 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms