Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NipblQ6KCD5 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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