Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Usf1Q61069 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf1Q61069 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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