Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rnf149Q3U2C5 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rnf149Q3U2C5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rnf149Q3U2C5 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rnf149Q3U2C5 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Rnf149Q3U2C5 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf149Q3U2C5 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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