Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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