Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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