Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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