Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VdrP48281 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VdrP48281 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms