Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms