Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DffaO54786 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DffaO54786 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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DffaO54786 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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DffaO54786 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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DffaO54786 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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DffaO54786 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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DffaO54786 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DffaO54786 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DffaO54786 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DffaO54786 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DffaO54786 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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