Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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Gm2056J3QQ02 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm2056J3QQ02 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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