Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Spocd1B1ASB6 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Spocd1B1ASB6 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Spocd1B1ASB6 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Spocd1B1ASB6 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Spocd1B1ASB6 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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