Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Grik3B1AS29 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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