Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trbv21A0A0A6YX06 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trbv21A0A0A6YX06 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trbv21A0A0A6YX06 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms