Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms